Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia / Impactos ecológicos da mudança climática no leopardo-da-neve (Panthera uncia) no sul da Ásia

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia

Abstract Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its preys population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

Resumo O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia / Impactos ecológicos da mudança climática no leopardo-da-neve (Panthera uncia) no sul da Ásia

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Assessment of ecto and endo parasites of Schizothorax plagiostomus inhabiting river Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Avaliação de ecto e endoparasitas de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Abstract Fish provides main source of high quality protein to more than one billion people in the world. Fish parasites directly affect the productivity of fish and indirectly on human health. This research was aimed to assess the helminth parasites in Schizothorax plagiostomus (the snow trout) from river Panjkora, KP, Pakistan. A total of 88 fish samples (n= 88) were collected from the upper, middle and lower regions of the river through cast nets, hand nets and hooks. All the collected fish samples were examined in the Parasitology Laboratory, Department of Zoology, University of Malakand for helminth parasites during July 2018 to February 2019.Among these fishes nematodes, trematodes, cestodes and acanthocephalan were isolated and identified. Overall prevalence of the fish parasites was 60.22% (53/88). The intensity of the parasite was observed from 1.7% to 4.61%. Highest prevalence was reported in summer season 86.36% while lowest in the winter season 36.36%. This study shows that summer season affects the fish business and result in poor quality fish meat with risk of zoonotic diseases. Adults were highly infected 82.25% while no infection was found in juvenile specimens. Female fish samples had higher prevalence 68.22% than males 48.22%. Fishes of the lower reaches had highest prevalence 60.22% than the upper reaches 40.0%. Fish samples with maximum length and weight were highly 76.92% infected than small sized fish with low body weight. Present study addresses that Rhabdochona schizothoracis in the intestine and Diplozoon paradoxum in gills of snow trout fish has a long term relationship and call as a natural infection in cyprinids and it is zoonotic threat to human.

Resumo O peixe é a principal fonte de proteína de alta qualidade para mais de um bilhão de pessoas no mundo. Contudo, parasitas afetam diretamente a produtividade de peixes e, indiretamente, a saúde humana. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar os parasitas helmintos em Schizothorax plagiostomus (truta da neve) do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Foram coletadas 88 amostras de peixes (n = 88) dos trechos alto, médio e baixo do rio por meio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Todas as amostras de peixes coletadas foram examinadas no Laboratório de Parasitologia do Departamento de Zoologia, da Universidade de Malakand, quanto a parasitas helmintos durante o período de julho de 2018 a fevereiro de 2019. Entre esses peixes, nematódeos, trematódeos, cestóideos e acantocéfalos foram isolados e identificados. A prevalência geral de parasitas de peixes foi de 60,22% (53/88). A intensidade do parasita foi observada de 1,7 a 4,61%. A maior prevalência (86,36%) foi relatada no verão, enquanto a menor (36,36%), no inverno. Este estudo mostra que a temporada de verão afeta o ramo da pesca e resulta em carne de baixa qualidade, com risco de doenças zoonóticas. Os adultos foram altamente infectados (82,25%), enquanto nenhuma infecção foi encontrada em jovens. As amostras de peixes do sexo feminino apresentaram maior prevalência (68,22%) do que as do sexo masculino (48,22%). Os peixes coletados no trecho baixo do rio tiveram maior prevalência (60,22%) do que os do trecho alto (40%). Amostras de peixes com comprimento e peso máximos foram altamente infectadas (76,92%) do que peixes de pequeno porte e baixo peso corporal. O presente estudo aborda que Rhabdochona schizothoracis no intestino e Diplozoon paradoxum em brânquias de peixes de truta da neve possuem uma estreita relação que causa uma infecção natural em ciprinídeos, sendo uma ameaça zoonótica ao ser humano.

Evaluation of ecto and endo parasitic fauna of Schizothorax plagiostomus inhabitants of river Swat, Khyber PakhtunKhwa, Pakistan / Avaliação da fauna ecto e endoparasitária de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Swat, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Abstract Fish is consumed as a rich and cheaper source of white meat and proteins all over the world. Fish farming is the leading source of income generation throughout the world. The present research study was conducted with aims to investigate the ecto and endo parasitic fauna of S. plagiostomus (snow trout) in River Swat. A total of 96 fish samples were collected on monthly basis from July-2018 to February-2019, from upper, middle and lower reaches. Fish samples were collected with the help of cast net, hand net and fishing rods. Local fishermen and experts help were also sought out for fish collection. 61 out of 96 fishes were found infected by helminth parasites. The total prevalence and intensity of 63.54% and 2.90 was observed respectively during data analysis. Highest monthly prevalence of 83.33% was recorded during July and August, while lowest prevalence of 33.33% was noted during February. Five species of helminths parasites were detected from S. plagiostomus, of which two were trematodes (Rhabdochona shizothoracis and Rhabdochona species), one species of Monogenia (Diplozoon paraddoxum), one species of Cestodes (Nippotaenia species), and one species of Acanthocephalan (Neoechynorhynchus devdevi). Highest parasite wise prevalence, intensity and relative density of 21.87%, 4.09 and 0.895 was noted for R. schizothoracis while the lowest prevalence, intensity and relative density of 4.16%, 1.25 and 0.052 was noted for N. devdevi. Highest infection of 76.08% was observed in adults host while lowest, 40% infestation rate was observed in young fish samples. 73.68% prevalence was observed in female hosts while only 56.90% prevalence was observed in male individuals. Higher infection (83.33%) was noticed during summer season, while lowest infection (44.44%) was observed during winter season. Similarly 71.79% fishes were found infected that were collected from lower reaches of the River Swat than the fish samples collected from upper reaches (52%).

Resumo O peixe é consumido mundialmente por ser uma fonte rica e barata de carne branca e proteínas. A piscicultura é a principal fonte de geração de renda em todo o mundo. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de investigar a fauna ecto e endoparasitária de S. plagiostomus (truta da neve) no rio Swat. Foram coletadas mensalmente 96 amostras de peixes, no período de julho de 2018 a fevereiro de 2019, nos trechos alto, médio e baixo com auxílio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Pescadores locais e especialistas também ajudaram na coleta de peixes. Dos 96 peixes encontrados, 61 estavam infectados por parasitas helmintos. A prevalência de 63,54% e a intensidade total de 2,90 foram observadas durante a análise dos dados. A maior prevalência mensal de 83,33% foi registrada nos meses de julho e agosto, enquanto a menor, de 33,33%, em fevereiro. Cinco espécies de parasitas helmintos foram detectadas de S. plagiostomus, dos quais dois eram trematódeos (espécies Rhabdochona shizothoracis e Rhabdochona), uma espécie de monogenia (Diplozoon paradoxum), uma espécie de cestóideos (espécie Nippotaenia) e uma espécie de acantocéfalo (Neoechynorhynchus devdevi). As maiores prevalências de parasitas (21,87%), intensidade (4,09) e densidade relativa (0,895) foram observadas em R. schizothoracis, enquanto as menores prevalências de parasitas (4,16%), intensidade (1,25) e densidade relativa (0,052), em N. devdevi. A infecção mais alta (76,08%) foi constatada em adultos hospedeiros, ao passo que a taxa de infestação mais baixa (40%) foi encontrada em amostras de peixes jovens. A prevalência de 73,68% foi verificada em hospedeiros do sexo feminino, enquanto a de 56,90%, em indivíduos do sexo masculino. Maior infecção (83,33%) foi observada durante a temporada de verão, e a menor infecção (44,44%), durante o inverno. Da mesma forma, 71,79% dos peixes encontrados infectados foram coletados no trecho baixo do rio Swat, enquanto 52%, no trecho alto.

Assessment and incidence of fish associated bacterial pathogens at hatcheries of Azad Kashmir, Pakistan / Avaliação e incidência de patógenos bacterianos associados a peixes em incubadoras da Caxemira de Azad, Paquistão

Abstract Fish is the most indispensable source of proteins for individuals and have high nutritional value. On the other hand, the fish culturing raised issues of fish health due to close contact between the aquatic environment and the fish pathogens. So, the aim of the current study was to identify the bacterial pathogens and screen the injured Rainbow trout rearing in different trout hatcheries run under fisheries department of the government of Azad Jammu and Kashmir, Pakistan. Seven bacterial pathogens such as Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella Typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes, and Bacillus cereus were isolated and identified. Results revealed that the injury of fish specimens was due to overcrowding. Instead of rainbow coloration, specimens have darker black in color. The water of ponds was not clean and clear and such conditions was because of the greater quantity of feed thrown in the water. It was concluded that poor hygienic water condition and overloading allowed the opportunistic bacterial contaminations to succeed which cause a serious threat to hatcheries.

Resumo O peixe é a fonte mais indispensável de proteínas para os indivíduos e tem alto valor nutricional. Por outro lado, a cultura dos peixes levantou questões sobre a saúde dos peixes devido ao próximo contato entre o ambiente aquático e os agentes patogênicos desses peixes. Assim, o objetivo do presente estudo foi identificar os patógenos bacterianos e rastrear a criação da truta arco-íris que apresentou lesões em diferentes incubadoras de trutas, com supervisão do departamento de pesca do governo de Azad Jammu e Caxemira, Paquistão. Sete patógenos bacterianos foram isolados e identificados, tais como: Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes e Bacillus cereus. Os resultados revelaram que a lesão de espécimes de peixes foi devido à superlotação. Em vez da coloração do arco-íris, os espécimes tiveram uma coloração preta mais escura. A água das lagoas não era limpa e nem clara, e tais condições ocorreram devido a maior quantidade de alimento lançada na água. Concluiu-se que a precária condição higiênica da água e também a sobrecarga permitiram que as contaminações bacterianas oportunistas fossem bem-sucedidas, causando séria ameaça às incubadoras.

Morphology and ectoparasite spectrum of Pteropus vampyrus (the flying fox) in different parts of Malakand Division, Pakistan / Morfologia e espectro ectoparasitário de Pteropus vampyrus (raposa voadora) em diferentes partes da divisão de Malakand, Paquistão

Abstract Three districts viz. Lower Dir, Swat and Shangla in Khyber Pakhtunkhwa province, were surveyed for the collection of Pteropus vampyrus (the Indian flying fox) in Malakand division, the north western region of Pakistan from February to November 2018. A total of 35 specimens were captured. Out of the examined specimens 22 were found to be infected with ectoparasites. Three types of ectoparasites were observed including flies 20% (n=7/35), mites 28.5% (n=10/35) and bugs 14.2% (n=5/35). Male bats were more infected 57.1% (n=20/35) as compared to females 42.8% (n=15/35), however, no significant difference (p>0.05) was noted. Flies were recovered from wings membrane and head region, mites were found on wings, ears and around eyes while bugs were found attached on body surface and neck region. Body weight, circumference and wing span of male bats were greater as compared to female bats and were considered a key factor in clear cut identification of male and female Pteropus vampyrus (the Indian flyingfox). It was concluded that Pteropus vampyrus from north western part of Pakistan were parasitized by a varied parasite fauna with high infestation rates. We assume that in male bats the number of parasites is generally higher than in females. Our results revealed new insights into parasite fauna of Pteropus vampyrus.

Resumo Três distritos, Lower Dir, Swat e Shangla, em Khyber Pakhtunkhwa, foram pesquisados para a recolha de Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana) na divisão de Malakand, região noroeste do Paquistão, de fevereiro a novembro de 2018. Foram capturados 35 espécimes, dos quais 22 foram infectados com ectoparasitas. Três tipos de ectoparasitas foram observados: moscas (20%; n = 7/35), ácaros (28,5%; n = 10/35) e insetos (14,2%; n = 5/35). Os morcegos machos foram mais infectados (57,1%; n = 20/35) do que as fêmeas (42,8%; n = 15/35); porém, nenhuma diferença significativa foi observada (p > 0,05). As moscas foram recuperadas da membrana das asas e da região da cabeça; já os ácaros foram encontrados nas asas, nas orelhas e ao redor dos olhos; por sua vez, os insetos foram encontrados na superfície do corpo e na região do pescoço. O peso corporal, a circunferência e a envergadura dos morcegos machos foram maiores em comparação aos morcegos fêmeas e foram considerados um fator-chave na identificação dos machos e das fêmeas Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana). Conclui-se que os Pteropus vampyrus da parte noroeste do Paquistão foram parasitados por uma fauna variada de parasitas com altas taxas de infestação. Assume-se que, em morcegos machos, o número de parasitas é geralmente maior que em fêmeas. Os resultados deste estudo revelaram novos insights sobre a fauna parasita de Pteropus vampyrus.

Prevalence, serotyping and antimicrobials resistance mechanism of Salmonella enterica isolated from clinical and environmental samples in Saudi Arabia

Abstract Salmonella is recognized as a common foodborne pathogen, causing major health problems in Saudi Arabia. Herein, we report epidemiology, antimicrobial susceptibility and the genetic basis of resistance among S. enterica strains isolated in Saudi Arabia. Isolation of Salmonella spp. from clinical and environmental samples resulted in isolation of 33 strains identified as S. enterica based on their biochemical characteristics and 16S-rDNA sequences. S. enterica serovar Enteritidis showed highest prevalence (39.4%), followed by S. Paratyphi (21.2%), S. Typhimurium (15.2%), S. Typhi and S. Arizona (12.1%), respectively. Most isolates were resistant to 1st and 2nd generation cephalosporin; and aminoglycosides. Moreover, several S. enterica isolates exhibited resistance to the first-line antibiotics used for Salmonellosis treatment including ampicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole and chloramphenicol. In addition, the results revealed the emergence of two S. enterica isolates showing resistance to third-generation cephalosporin. Analysis of resistance determinants in S. enterica strains (n = 33) revealed that the resistance to β-lactam antibiotics, trimethoprim-sulfamethoxazole, chloramphenicol, and tetracycline, was attributed to the presence of carb-like, dfrA1, floR, tetA gene, respectively. On the other hand, fluoroquinolone resistance was related to the presence of mutations in gyrA and parC genes. These findings improve the information about foodborne Salmonella in Saudi Arabia, alarming the emergence of multi-drug resistant S. enterica strains, and provide useful data about the resistance mechanisms.

Morphology and ectoparasite spectrum of Pteropus vampyrus (the flying fox) in different parts of Malakand Division, Pakistan

Abstract Three districts viz. Lower Dir, Swat and Shangla in Khyber Pakhtunkhwa province, were surveyed for the collection of Pteropus vampyrus (the Indian flying fox) in Malakand division, the north western region of Pakistan from February to November 2018. A total of 35 specimens were captured. Out of the examined specimens 22 were found to be infected with ectoparasites. Three types of ectoparasites were observed including flies 20% (n=7/35), mites 28.5% (n=10/35) and bugs 14.2% (n=5/35). Male bats were more infected 57.1% (n=20/35) as compared to females 42.8% (n=15/35), however, no significant difference (p>0.05) was noted. Flies were recovered from wings membrane and head region, mites were found on wings, ears and around eyes while bugs were found attached on body surface and neck region. Body weight, circumference and wing span of male bats were greater as compared to female bats and were considered a key factor in clear cut identification of male and female Pteropus vampyrus (the Indian flyingfox). It was concluded that Pteropus vampyrus from north western part of Pakistan were parasitized by a varied parasite fauna with high infestation rates. We assume that in male bats the number of parasites is generally higher than in females. Our results revealed new insights into parasite fauna of Pteropus vampyrus.

Resumo Três distritos, Lower Dir, Swat e Shangla, em Khyber Pakhtunkhwa, foram pesquisados para a recolha de Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana) na divisão de Malakand, região noroeste do Paquistão, de fevereiro a novembro de 2018. Foram capturados 35 espécimes, dos quais 22 foram infectados com ectoparasitas. Três tipos de ectoparasitas foram observados: moscas (20%; n = 7/35), ácaros (28,5%; n = 10/35) e insetos (14,2%; n = 5/35). Os morcegos machos foram mais infectados (57,1%; n = 20/35) do que as fêmeas (42,8%; n = 15/35); porém, nenhuma diferença significativa foi observada (p > 0,05). As moscas foram recuperadas da membrana das asas e da região da cabeça; já os ácaros foram encontrados nas asas, nas orelhas e ao redor dos olhos; por sua vez, os insetos foram encontrados na superfície do corpo e na região do pescoço. O peso corporal, a circunferência e a envergadura dos morcegos machos foram maiores em comparação aos morcegos fêmeas e foram considerados um fator-chave na identificação dos machos e das fêmeas Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana). Conclui-se que os Pteropus vampyrus da parte noroeste do Paquistão foram parasitados por uma fauna variada de parasitas com altas taxas de infestação. Assume-se que, em morcegos machos, o número de parasitas é geralmente maior que em fêmeas. Os resultados deste estudo revelaram novos insights sobre a fauna parasita de Pteropus vampyrus.

Assessment and incidence of fish associated bacterial pathogens at hatcheries of Azad Kashmir, Pakistan

Abstract Fish is the most indispensable source of proteins for individuals and have high nutritional value. On the other hand, the fish culturing raised issues of fish health due to close contact between the aquatic environment and the fish pathogens. So, the aim of the current study was to identify the bacterial pathogens and screen the injured Rainbow trout rearing in different trout hatcheries run under fisheries department of the government of Azad Jammu and Kashmir, Pakistan. Seven bacterial pathogens such as Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella Typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes, and Bacillus cereus were isolated and identified. Results revealed that the injury of fish specimens was due to overcrowding. Instead of rainbow coloration, specimens have darker black in color. The water of ponds was not clean and clear and such conditions was because of the greater quantity of feed thrown in the water. It was concluded that poor hygienic water condition and overloading allowed the opportunistic bacterial contaminations to succeed which cause a serious threat to hatcheries.

Resumo O peixe é a fonte mais indispensável de proteínas para os indivíduos e tem alto valor nutricional. Por outro lado, a cultura dos peixes levantou questões sobre a saúde dos peixes devido ao próximo contato entre o ambiente aquático e os agentes patogênicos desses peixes. Assim, o objetivo do presente estudo foi identificar os patógenos bacterianos e rastrear a criação da truta arco-íris que apresentou lesões em diferentes incubadoras de trutas, com supervisão do departamento de pesca do governo de Azad Jammu e Caxemira, Paquistão. Sete patógenos bacterianos foram isolados e identificados, tais como: Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes e Bacillus cereus. Os resultados revelaram que a lesão de espécimes de peixes foi devido à superlotação. Em vez da coloração do arco-íris, os espécimes tiveram uma coloração preta mais escura. A água das lagoas não era limpa e nem clara, e tais condições ocorreram devido a maior quantidade de alimento lançada na água. Concluiu-se que a precária condição higiênica da água e também a sobrecarga permitiram que as contaminações bacterianas oportunistas fossem bem-sucedidas, causando séria ameaça às incubadoras.

Assessment of ecto and endo parasites of Schizothorax plagiostomus inhabiting river Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Abstract Fish provides main source of high quality protein to more than one billion people in the world. Fish parasites directly affect the productivity of fish and indirectly on human health. This research was aimed to assess the helminth parasites in Schizothorax plagiostomus (the snow trout) from river Panjkora, KP, Pakistan. A total of 88 fish samples (n= 88) were collected from the upper, middle and lower regions of the river through cast nets, hand nets and hooks. All the collected fish samples were examined in the Parasitology Laboratory, Department of Zoology, University of Malakand for helminth parasites during July 2018 to February 2019.Among these fishes nematodes, trematodes, cestodes and acanthocephalan were isolated and identified. Overall prevalence of the fish parasites was 60.22% (53/88). The intensity of the parasite was observed from 1.7% to 4.61%. Highest prevalence was reported in summer season 86.36% while lowest in the winter season 36.36%. This study shows that summer season affects the fish business and result in poor quality fish meat with risk of zoonotic diseases. Adults were highly infected 82.25% while no infection was found in juvenile specimens. Female fish samples had higher prevalence 68.22% than males 48.22%. Fishes of the lower reaches had highest prevalence 60.22% than the upper reaches 40.0%. Fish samples with maximum length and weight were highly 76.92% infected than small sized fish with low body weight. Present study addresses that Rhabdochona schizothoracis in the intestine and Diplozoon paradoxum in gills of snow trout fish has a long term relationship and call as a natural infection in cyprinids and it is zoonotic threat to human.

Resumo O peixe é a principal fonte de proteína de alta qualidade para mais de um bilhão de pessoas no mundo. Contudo, parasitas afetam diretamente a produtividade de peixes e, indiretamente, a saúde humana. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar os parasitas helmintos em Schizothorax plagiostomus (truta da neve) do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Foram coletadas 88 amostras de peixes (n = 88) dos trechos alto, médio e baixo do rio por meio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Todas as amostras de peixes coletadas foram examinadas no Laboratório de Parasitologia do Departamento de Zoologia, da Universidade de Malakand, quanto a parasitas helmintos durante o período de julho de 2018 a fevereiro de 2019. Entre esses peixes, nematódeos, trematódeos, cestóideos e acantocéfalos foram isolados e identificados. A prevalência geral de parasitas de peixes foi de 60,22% (53/88). A intensidade do parasita foi observada de 1,7 a 4,61%. A maior prevalência (86,36%) foi relatada no verão, enquanto a menor (36,36%), no inverno. Este estudo mostra que a temporada de verão afeta o ramo da pesca e resulta em carne de baixa qualidade, com risco de doenças zoonóticas. Os adultos foram altamente infectados (82,25%), enquanto nenhuma infecção foi encontrada em jovens. As amostras de peixes do sexo feminino apresentaram maior prevalência (68,22%) do que as do sexo masculino (48,22%). Os peixes coletados no trecho baixo do rio tiveram maior prevalência (60,22%) do que os do trecho alto (40%). Amostras de peixes com comprimento e peso máximos foram altamente infectadas (76,92%) do que peixes de pequeno porte e baixo peso corporal. O presente estudo aborda que Rhabdochona schizothoracis no intestino e Diplozoon paradoxum em brânquias de peixes de truta da neve possuem uma estreita relação que causa uma infecção natural em ciprinídeos, sendo uma ameaça zoonótica ao ser humano.

Evaluation of ecto and endo parasitic fauna of Schizothorax plagiostomus inhabitants of river Swat, Khyber PakhtunKhwa, Pakistan

Abstract Fish is consumed as a rich and cheaper source of white meat and proteins all over the world. Fish farming is the leading source of income generation throughout the world. The present research study was conducted with aims to investigate the ecto and endo parasitic fauna of S. plagiostomus (snow trout) in River Swat. A total of 96 fish samples were collected on monthly basis from July-2018 to February-2019, from upper, middle and lower reaches. Fish samples were collected with the help of cast net, hand net and fishing rods. Local fishermen and experts help were also sought out for fish collection. 61 out of 96 fishes were found infected by helminth parasites. The total prevalence and intensity of 63.54% and 2.90 was observed respectively during data analysis. Highest monthly prevalence of 83.33% was recorded during July and August, while lowest prevalence of 33.33% was noted during February. Five species of helminths parasites were detected from S. plagiostomus, of which two were trematodes (Rhabdochona shizothoracis and Rhabdochona species), one species of Monogenia (Diplozoon paraddoxum), one species of Cestodes (Nippotaenia species), and one species of Acanthocephalan (Neoechynorhynchus devdevi). Highest parasite wise prevalence, intensity and relative density of 21.87%, 4.09 and 0.895 was noted for R. schizothoracis while the lowest prevalence, intensity and relative density of 4.16%, 1.25 and 0.052 was noted for N. devdevi. Highest infection of 76.08% was observed in adults host while lowest, 40% infestation rate was observed in young fish samples. 73.68% prevalence was observed in female hosts while only 56.90% prevalence was observed in male individuals. Higher infection (83.33%) was noticed during summer season, while lowest infection (44.44%) was observed during winter season. Similarly 71.79% fishes were found infected that were collected from lower reaches of the River Swat than the fish samples collected from upper reaches (52%).

Resumo O peixe é consumido mundialmente por ser uma fonte rica e barata de carne branca e proteínas. A piscicultura é a principal fonte de geração de renda em todo o mundo. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de investigar a fauna ecto e endoparasitária de S. plagiostomus (truta da neve) no rio Swat. Foram coletadas mensalmente 96 amostras de peixes, no período de julho de 2018 a fevereiro de 2019, nos trechos alto, médio e baixo com auxílio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Pescadores locais e especialistas também ajudaram na coleta de peixes. Dos 96 peixes encontrados, 61 estavam infectados por parasitas helmintos. A prevalência de 63,54% e a intensidade total de 2,90 foram observadas durante a análise dos dados. A maior prevalência mensal de 83,33% foi registrada nos meses de julho e agosto, enquanto a menor, de 33,33%, em fevereiro. Cinco espécies de parasitas helmintos foram detectadas de S. plagiostomus, dos quais dois eram trematódeos (espécies Rhabdochona shizothoracis e Rhabdochona), uma espécie de monogenia (Diplozoon paradoxum), uma espécie de cestóideos (espécie Nippotaenia) e uma espécie de acantocéfalo (Neoechynorhynchus devdevi). As maiores prevalências de parasitas (21,87%), intensidade (4,09) e densidade relativa (0,895) foram observadas em R. schizothoracis, enquanto as menores prevalências de parasitas (4,16%), intensidade (1,25) e densidade relativa (0,052), em N. devdevi. A infecção mais alta (76,08%) foi constatada em adultos hospedeiros, ao passo que a taxa de infestação mais baixa (40%) foi encontrada em amostras de peixes jovens. A prevalência de 73,68% foi verificada em hospedeiros do sexo feminino, enquanto a de 56,90%, em indivíduos do sexo masculino. Maior infecção (83,33%) foi observada durante a temporada de verão, e a menor infecção (44,44%), durante o inverno. Da mesma forma, 71,79% dos peixes encontrados infectados foram coletados no trecho baixo do rio Swat, enquanto 52%, no trecho alto.

Alkaline protease from a new halotolerant alkaliphilic Bacillus agaradhaerens strain ak-r isolated from egyptian soda lakes / Protease alcalina de uma nova estirpe ak-r halotolerante e alcalófila de Bacillus agaradhaerens isolada a partir dos lagos alcalinos egípcios

Alkaline proteases are hydrolytic enzymes that cleave peptide bonds in proteins and peptides in alkaline conditions, which occupy a pivotal importance with respect to their industrial applications. This study aimed to isolate new alkaline protease producing alkaliphilic bacteria from Egyptian soda lakes and optimize the fermentation process to enhance the enzyme production. The extensive screening process of the samples collected from Egyptian soda lakes resulted in isolation of a potent alkaline protease producing alkaliphilic strain AK-R. The isolate was identified as Bacillus agaradhaerens strain AK-R based on 16S rRNA gene analysis (99%). Wheat bran and gelatin supported maximum alkaline protease production as carbon and nitrogen sources, respectively. Strain AK-R is halo-tolerant thermotolerant alkaliphilic bacterium in nature, as it can grow over a wide range of NaCl concentrations (up to 25%) and up to 55 °C, with maximal growth and enzyme production at 2.5-5%, and pH 11 at 35 °C. Among the tested cations, only Mg2+ and Ca2+ ions significantly enhanced the enzyme production by about 1.2, and 1.3 fold compared to control, respectively. Alkaline protease secretion was coherent with the growth pattern, reaching maximal yield after about 32 h (mid stationary phase). In conclusion a new halo-tolerant thermo-tolerant alkaliphilic alkaline protease producing Bacillus agaradhaerens strain AK-R was isolated from Egyptian soda lakes. Optimization of the nutritional and cultivation conditions resulted in increase of enzyme yield by 20 fold. Strain AK-R and its extracellular alkaline protease with salt, pH and temperature, tolerance signify their potential application in laundry and pharmaceuticals industries.

Proteases alcalinas são enzimas hidrolíticas que quebram ligações peptídicas em proteínas e peptídeos em condições alcalinas, o que ocupa uma importância fundamental em relação às suas aplicações industriais. Este estudo teve como objetivo isolar novas proteases alcalinas e produzir bactérias alcalófilas a partir dos lagos salgados alcalinos egípcios e otimizar o processo de fermentação para aumentar a produção de enzimas. O extensivo processo de triagem das amostras coletadas dos lagos salgados alcalinos egípcios resultou no isolamento de uma protease alcalina potente produzindo uma estirpe alcalófila AK-R. O isolado foi identificado como sendo a estirpe AK-R de Bacillus agaradhaerens baseado na análise de genes 16S rRNA (99%). O farelo de trigo e a gelatina suportaram a produção máxima de protease alcalina como fontes de carbono e nitrogênio, respectivamente. A estirpe AK-R é uma bactéria alcalófila halotolerante e termotolerante, pois pode crescer dentro de uma vasta gama de concentrações de NaCl (até 25%) e até 55ºC, com crescimento e produção de enzimas máximos a 2.5-5% e pH 11 a 35ºC. Dentre os cátions testados, somente os íons Mg2+ e Ca2+ aumentaram significativamente a produção de enzimas em cerca de 1.2 e 1.3 em comparação ao controle, respectivamente. A secreção de protease alcalina foi coerente com o padrão de crescimento, atingindo o rendimento máximo após 32h (fase estacionária média). Pode-se concluir que uma nova estirpe AK-R de Bacillus agaradhaerens halotolerante, termotolerante e alcalófila produtora de protease alcalina foi isolada a partir dos lagos salgados alcalinos egípcios. A otimização das condições de nutrição e cultivo resultou num aumento da produção de enzima em 20 vezes. A estirpe AK-R e a sua protease alcalina extracelular com tolerância ao sal, pH e temperatura tornam significantes as suas potenciais aplicações nas indústrias farmacêutica e de lavanderia.

Possible Therapeutic Effect of Stem Cell in Atherosclerosis in Albino Rats. A Histological and Immunohistochemical Study

BACKGROUND: Atherosclerosis is the leading cause of death worldwide. there are no effective approaches to regressing atherosclerosis due to not fully understood mechanisms. Recently, stem cell-based therapies have held promises to various diseases, including vascular diseases. AIM: The present study aimed at investigating the possible effect of cord blood mesenchymal stem cell (MSC) therapy on atherosclerosis. MATERIAL AND METHODS: Eighty adult male albino rats were divided into control group (I), atherogenic group (II): subjected to high cholesterol fed diet (200~300 mg/kg body weight) for 12 weeks and 1.8 million units of vitamin D / kg of diet for 6 weeks. Stem cell therapy group (III): injected with stem cells in the tail vein following confirmation of atherosclerosis. Histological, Immunohistochemical and morphometric studies were performed were conducted. RESULTS: Atherogenic group (II) showed increased aortic thickness, intimal proliferation, smooth muscle proliferation and migration. Increased area % of collagen fibers, iNOS and vimentin immunoreactions were recorded and proved morphometrically. All findings regressed on stem cell therapy. CONCLUSION: A definite therapeutic effect of mesenchymal stem cells was found on atherosclerosis.

comparative study of bovine bone used alone and in combination with transforming growth factor-beta for the treatment of periodontal osseous defects in humans

Objectives: Transforming growth factor-betas [TGF[beta]s] are multifunctional growth factors with a broad range of biological activities in various cell types in many different tissues. The purpose of this study was to evaluate the treatment of intrabony defects with anorganic bovine bone mineral matrix combined with TGF[beta]-1 with the use of anorganic bovine bone alone

Materials and Methods: Thirty-two sites from sixteen patients were selected using a split-mouth study design for each patient, determined randomly through a biased coin randomization. One site received a mucoperiosteal flap, and the osseous defect was fi lled with the combined therapy [Group 1]. The other site treated was with anorganic bovine bone alone and served as a control [Group 2]. All the treated sites were covered with a bioabsorbable collagen membrane. The clinical parameters and radiographic follow-up examinations were recorded after 3, 6, 9, and 12 months

Results: Clinically, there was a statistically signifi cant gain in the clinical attachment level [+5.03 +/- 0.14 mm] and a statistically signifi cant reduction of pocket probing depth [?5.16 mm +/- 0.13] for Group 1 sites compared to sites in Group 2 [P

Conclusions: The use of anorganic bovine bone mineral matrix combined with TGF[beta]-1 seemed to be effective in the treatment of intrabony defects. This showed an improvement in the clinical outcome of periodontal therapy superior to the use of anorganic bovine bone on its own

Efficacy of implementation of a 5 scale pediatric triage and acuity scale in pediatric emergency, Saudi Arabia

To evaluate the effectiveness of implementation of the pediatric Canadian Triage and Acuity Scale [Ped-CTAS] for children visiting the pediatric emergency department [ED]. This cross-sectional study evaluated all children presented to the ED during a 9-day period in March 2010. The Ped-CTAS triage system was used. Triage performance was analyzed on the basis of quality indicators, rate of admissions, rate of referral, observation duration, and relationship between investigations requested and CTAS level. During the study period, 3,337 patients were triaged. Overall, 4 patients [0.1%] were in triage level 1, 356 [[12%] were level 2, 655 [22%] were level 3, 1810 [60%] were level 4, and 189 [6%] were level 5. The left without being seen rate was 6.25%. A triage duration of 5 minutes or less was carried out for 97% of cases. Within the CTAS time objectives, the waiting time to nurse and physician was 100% for cases triaged to level 1. The proportion of cases who needed observation was 100% for level 1, 85% for level 2, 53% for level 3, 33% for level 4, and 26% for level 5. The proportion of patients admitted to the hospital was 100% for level 1. The lower the level [more acute and emergent the condition] the more use of the laboratory and radiological investigations. The pediatric CTAS triage system is a good tool for categorizing pediatric patients attending the ED. Stratified by triage level, triage indicators can be used as indicators of ED performance